Στο Κύπελλο μετέχουν υποχρεωτικά οι ομάδες της Γ’ Εθνικής (Παλαιόχωρα, ΣΥΝΚΑ), οι ομάδες της Α’ Κατηγορίας, ενώ προαιρετική είναι η συμμετοχή για τις ομάδες Β’ και Γ’ Κατηγορίας, αλλά και για τις ερασιτεχνικές ομάδες των σωματείων που ίδρυσαν ΠΑΕ (Πλατανιάς, ΑΟΧ/Κισσαμικός).
